未來世界，感染了X病毒的惡魔黨攜帶威力強大的赤盾出現在地球各個角落。僅僅是七天的時間，地球一半的領土便宣告陷落。人們流離失所，躲在最後的保留地苟延殘喘。國際科學技術廳（ISO）的南部博士（岸谷五朗 飾）發現一種神祕的石頭可以賦予特定人群以強大的力量，而力量提升後的超級戰士正是阻擋惡魔黨的不二人選。在此之後，鷲尾健（鬆阪桃李 飾）、大月純（剛力彩芽 飾）、大月甚平（濱田龍臣 飾）和中西龍（鈴木良平 飾）等人得到ISO的發掘，經過連番常人難以想象的特訓，他們成長為對抗惡魔黨的科學忍者隊戰士。某次戰鬥後，健的老友淺倉喬治（綾野剛 飾）加入進來，他們奉命去保護惡魔黨逃亡過來的頭目伊利亞（中村獅童 飾），以期獲取Last Suicide計劃的詳情。 面對這個有著深仇大恨的敵人，健和喬治的內心悄悄發生著變化……